Комплекcный инновационный проект "Разработка комплекcа программных компонентов для компьютерного моделирования и дизайна в облаcти поcтгеномной cиcтемной биологии (cиcтемная биология in silico)" выполняетcя под руководcтвом зам. директора Инcтитута цитологии и генетики СО РАН чл.-корр. РАН Н.А.Колчанова (Головная организация ИЦиГ СО РАН) и при учаcтии Научно-иcследовательского института физико-химической медицины (ФГУ НИИ ФХМ), (д.б.н., проф. В М. Говорун); Центра "Биоинженерия" РАН, (акад. РАСХН К.Г.Скрябин), Центра перспективных исследований Санкт-Петербургского политехнического университета (к.б.н., доцент М.Г.Самсонова), некоммерческого партнерства содействия развитию ИТ "Сибакадемсофт", факультета информационных технологий Новосибирского госуниверситета (д.ф.-м.н., проф. М.М.Лаврентьев).
Цель проекта - создание многопользовательского интегрированного программного комплекса "Системная биология", ориентированного на конвейерную обработку данных и решение комплексных проблем при проведении научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ в области биоинженерии, биотехнологии, биомедицины и системной биологии, направленных на создание конкурентоспособных продуктов, их ускоренное внедрение в практику и выход на рынок. Функциональной основой интегрированного программного комплекса является множество взаимосвязанных прикладных программных компонент с широким спектром функциональных возможностей, предназначенных для: реконструкции генных сетей, метаболических, регуляторных систем клеток, тканей, органов, организмов на основе интеграции и анализа многопараметрических гетерогенных экспериментальных данных, получаемых методами геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики, клеточной биологии; создания компьютерных баз данных и знаний, содержащих интегрированную информацию по структурно-функциональной организации и динамике генных сетей от уровня гена до уровня целостного организма; поддержки эксперимента при изучении ген-генных взаимодействий в бактериальной клетке; изучения механизмов функционирования бактериальных геномов и создания компьютерных моделей функционирования бактериальных клеток; решения задач бактериальной метаболомики и метаболической инженерии; экспериментального дизайна искусственных генных сетей с принципиально улучшенными или качественно новыми свойствами с целью их практического применения в биоинженерии, биотехнологии и медицине; построения многопараметрических моделей взаимодействия патогенов с организмом для медицински значимых микроорганизмов; создания генно-сенсорных устройств на основе бактериальных систем; анализа экспериментальных данных по молекулярной эпидемиологии социально-значимых заболеваний и популяционному полиморфизму ДНК; анализа экспериментальных данных при высокоточной генетической идентификации личности; компьютерного моделирования сложных пространственно-распределенных систем и процессов, контролируемых генами, с целью создания трансгенных растений с качественно новыми или улучшенными свойствами.