Согласно проектной документации, железнодорожные пути будут сквозными. Таким образом, через станцию «Толмачево» поезда будут отправляться в другие районы – Томск, Омск, Барнаул и Кемерово и доставлять их жителей в терминал международного аэропорта.
РЖД планирует строительство железнодорожного полотна и дальнейшую эксплуатацию железнодорожного состава. На эти цели руководство планирует потратить 5 млрд. рублей. Силами компании «Новапорт» будут начато сооружение железнодорожной станции рядом с аэропортом. Инвестиции в это строительство составят примерно 600 млн. рублей. Из бюджета Новосибирской области будет выделен 1 млрд. рублей капиталовложений на реализацию строительства автомобильных развязок и переездов.
Реализовать масштабный проект планируется в течение четырех лет. Помимо устройства железнодорожной ветки планируется организовать до аэропорта «Толмачево» полноценного автобусного сообщения. В этих целях здание автовокзала будет перенесено в другое место и модернизировано.